Dass du das veränderte Aussehen der Einheiten beschreibst, macht mich etwas stutzig.
Obwohl du bereits beschrieben hast, dass du bereits neu installiert hast, würde ich den Fehler hier vermuten. Also am besten nochmal deinstallieren vor der Neuinstallation den Battlefront II-Ordner im LucasArts-Verzeichnis löschen.
Bei den Patches musst du etwas aufpassen, wegen der vielen verschiedenen Versionen, deswegen teste erstmal das Spiel, bevor du patchst (dies gilt auch für 1.3) oder das ConvoPack oder etwas anderes installierst.